Das «Märlitheater Zürich» wurde 1966 von Otto Dewald, dem damaligen Leiter des Bernhard-Theaters Zürich, als «Schweizer Kinder- und Jugendtheater» gegründet. 1974 übernahm Rolf Kunz die Leitung und erweiterte den Wirkungskreis der Bühne weit übers Bernhard-Theater hinaus auf die ganze Schweiz aus. Im März 2006 übergab er die Leitung den langjährigen Ensemblemitgliedern Nicole Haas-Clerici und Ruedi Haas. Mit der Saison 2024/25 gab es erneut einen Wechsel: Debi Althuser und Gianni Pfister übernahmen die Künstlerische Leitung, Nicole und Ruedi Haas zogen sich aus dem operativen Geschäft zurück, sie verbleiben aber noch bis Ende des Vereinsjahres im Vereinsvorstand.
Nach "Pinocchio" kommt jetzt 2025 eine neue und spannende Geschichte vom bekannten Autor Michael Ende auf die Bühne: Der Wunschpunsch.